Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scaf4Q6PFF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf4Q6PFF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms