Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sarm1Q6PDS3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sarm1Q6PDS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms