Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RgmaQ6PCX7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RgmaQ6PCX7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms