Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc4Q6PAV2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms