Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab2Q6PAM0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prkab2Q6PAM0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Prkab2Q6PAM0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Prkab2Q6PAM0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms