Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BcrQ6PAJ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BcrQ6PAJ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcrQ6PAJ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms