Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atl2Q6PA06 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl2Q6PA06 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms