Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtss1lQ6P9S0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtss1lQ6P9S0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mtss1lQ6P9S0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mtss1lQ6P9S0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mtss1lQ6P9S0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtss1lQ6P9S0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtss1lQ6P9S0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtss1lQ6P9S0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms