Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp49Q6P9L4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms