Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frg2f1Q6P3A2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frg2f1Q6P3A2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms