Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpbp1l1Q6NZP2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpbp1l1Q6NZP2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms