Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nckap5lQ6GQX2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nckap5lQ6GQX2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Nckap5lQ6GQX2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms