Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9bQ6EBV9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atg9bQ6EBV9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg9bQ6EBV9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms