Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6DFW0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6DFW0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6DFW0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6DFW0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6DFW0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q6DFW0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q6DFW0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q6DFW0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q6DFW0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6DFW0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6DFW0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6DFW0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6DFW0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6DFW0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6DFW0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6DFW0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6DFW0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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