Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pram1Q6BCL1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pram1Q6BCL1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pram1Q6BCL1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pram1Q6BCL1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pram1Q6BCL1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms