Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brsk2Q69Z98 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brsk2Q69Z98 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brsk2Q69Z98 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brsk2Q69Z98 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brsk2Q69Z98 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Brsk2Q69Z98 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brsk2Q69Z98 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms