Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn4Q69Z26 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn4Q69Z26 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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