Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3ipQ68EF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3ipQ68EF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms