Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp4fQ66X05 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4fQ66X05 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms