Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ino80dQ66JY2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms