Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccpg1Q640L3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccpg1Q640L3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccpg1Q640L3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccpg1Q640L3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccpg1Q640L3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccpg1Q640L3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms