Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phc1Q64028 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phc1Q64028 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms