Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PatjQ63ZW7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PatjQ63ZW7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PatjQ63ZW7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PatjQ63ZW7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms