Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd33Q63994 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd33Q63994 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms