Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sp4Q62445 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sp4Q62445 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp4Q62445 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sp4Q62445 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms