Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha6Q62413 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha6Q62413 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms