Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl12Q62401 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms