Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tff3Q62395 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff3Q62395 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms