Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six2Q62232 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Six2Q62232 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Six2Q62232 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six2Q62232 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six2Q62232 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Six2Q62232 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms