Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4bQ62179 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4bQ62179 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema4bQ62179 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms