Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx3xQ62167 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx3xQ62167 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms