Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim27Q62158 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim27Q62158 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim27Q62158 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.1 ms