Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi47Q61635 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi47Q61635 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifi47Q61635 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifi47Q61635 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifi47Q61635 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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