Protein–RNA interactions for Protein: Q61527

Erbb4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb4Q61527 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Erbb4Q61527 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Erbb4Q61527 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Erbb4Q61527 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Erbb4Q61527 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Erbb4Q61527 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Erbb4Q61527 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms