Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccne1Q61457 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccne1Q61457 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccne1Q61457 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccne1Q61457 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms