Protein–RNA interactions for Protein: Q61288

Acvrl1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvrl1Q61288 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acvrl1Q61288 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acvrl1Q61288 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acvrl1Q61288 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms