Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc9a1Q61165 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a1Q61165 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms