Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TmpoQ61033 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TmpoQ61033 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TmpoQ61033 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TmpoQ61033 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TmpoQ61033 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TmpoQ61033 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TmpoQ61033 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms