Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxg1Q60987 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Foxg1Q60987 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxg1Q60987 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxg1Q60987 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxg1Q60987 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxg1Q60987 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxg1Q60987 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxg1Q60987 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxg1Q60987 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms