Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkn2cQ60772 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms