Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mkrn3Q60764 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms