Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samhd1Q60710 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Samhd1Q60710 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Samhd1Q60710 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms