Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Satb1Q60611 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Satb1Q60611 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Satb1Q60611 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms