Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Scaf1Q5U4C3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Scaf1Q5U4C3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Scaf1Q5U4C3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Scaf1Q5U4C3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms