Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip2Q5SQX6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip2Q5SQX6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms