Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PkdccQ5RJI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PkdccQ5RJI4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PkdccQ5RJI4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PkdccQ5RJI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms