Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm12253Q5NC48 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm12253Q5NC48 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm12253Q5NC48 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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