Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp13Q5BKP2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp13Q5BKP2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp13Q5BKP2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp13Q5BKP2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms