Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmtc2Q56A06 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms