Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDF6

Cfhr2, Complement factor H-related 2, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfhr2Q4LDF6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfhr2Q4LDF6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfhr2Q4LDF6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms